1、使用性质主体不同：商业用房的使用主体多为各类商店、门市部等商业用户，办公用房的使用主体多为企业、事业、机关等单位。
2、用途不同：商业用房主要是从事商业行为的所用的房屋，而办公用房是单位办公用的房屋。
3、基本楼层不同：商业用房一般是底层临街的房屋，办公用房一般是写字楼及独栋的房屋。
4、产权年限不同：商业用房的产权年限为40年，办公用房的产权年限为50年。
5、建设标准不同：办公用房有全国统一的建设标准，商业用房没有这一标准。
不过无论是商业用房还是办公用房产权到期后是可以申请续期的。产权到期，其实也就是土地使用证到期。根据规定，土地使用权出让合同约定的年限届满，土地使用者需要继续使用的，应当至迟于届满前一年申请续期。
